Hydrophobic and hydrophilic thin films for bioscreening purposes

Master's thesis

Riikka Aho

Research output: ThesisMaster's thesisTheses

Abstract

Työn tavoitteena oli valmistaa erittäin ohuita hydrofobisia pintoja ja biomolekyylejä puoleensa vetäviä pintoja. Näiden pintojen olisi tulevaisuudessa tarkoitus toimia apuna biomolekyylien seulonnassa. Tavoitteena oli valmistaa substraatti, jossa olisi hydrofobisia alueita, jotka hylkisivät biomolekyylejä (proteiineja) sekä alueita, joihin proteiinit puolestaan tarttuisivat. Hydrofobisina materiaaleina testattiin kaupallista Teflon AF:ia sekä kaupallisia fluorattuja akrylaatteja. Teflon AF:ia onnistuttiin kuvioimaan litografisia menetelmiä apuna käyttäen. Fluorattuja akrylaatteja yritettiin kuvioida fotolitografian avulla siinä kuitenkaan onnistumatta. Lisäksi yritettiin syntetisoida haarautuneen fluoratun sivuketjun sisältävää siloksaani-materiaalia julkaistua synteesireittiä noudattaen, mutta kyseistä siloksaania onnistuttiin valmistamaan vain todella vähäisiä määriä. Proteiineja puoleensa vetäviä, stabiileja pintoja onnistuttiin valmistamaan kahdella eri tekniikalla. Toisessa menetelmässä spinnattiin erään siloksaanin ja fluoresoivan väriaineen seosta substraatille, ja toisessa menetelmässä fluoresoiva väriaine sidottiin kovalenttisesti silyloidun substraatin pinnalle. Fluoresoivan väriaineen avulla voitiin tutkia proteiinien tarttumista väriainetta sisältävälle pinnalle käyttäen hyväksi pinnassa olevan väriaineen ja pinnalle kiinnittyneen leimatun proteiinin leimaväriaineen välillä tapahtuvaa energiansiirtoa (FRET = Fluoresenssi resonanssi energiansiirto). Mittauksilla saatiin osoitettua, että energiansiirtoa tapahtui kiinteän pinnan väriaineen ja liuoksessa olevan leimatun proteiinin leimaväriaineen välillä. Tämä tulos puolestaan osoittaa sen, että proteiinit todellakin tarttuivat valmistettuihin väriaine-pintoihin. Valmistettuja hydrofobisia ja proteiineja puoleensa vetäviä, väriaineen sisältäviä pintoja tullaan käyttämään hyväksi kehitettäessä edelleen tavoitteena ollutta kuvioitua substraattia.
Original languageEnglish
QualificationMaster Degree
Awarding Institution
  • University of Oulu
Place of PublicationOulu
Publisher
Publication statusPublished - 2005
MoE publication typeG2 Master's thesis, polytechnic Master's thesis

Fingerprint

Polytetrafluoroethylene

Cite this

Aho, Riikka. / Hydrophobic and hydrophilic thin films for bioscreening purposes : Master's thesis. Oulu : University of Oulu, 2005. 87 p.
@phdthesis{7a0656b59f914ae6bb9f9dedecce4097,
title = "Hydrophobic and hydrophilic thin films for bioscreening purposes: Master's thesis",
abstract = "Ty{\"o}n tavoitteena oli valmistaa eritt{\"a}in ohuita hydrofobisia pintoja ja biomolekyylej{\"a} puoleensa vet{\"a}vi{\"a} pintoja. N{\"a}iden pintojen olisi tulevaisuudessa tarkoitus toimia apuna biomolekyylien seulonnassa. Tavoitteena oli valmistaa substraatti, jossa olisi hydrofobisia alueita, jotka hylkisiv{\"a}t biomolekyylej{\"a} (proteiineja) sek{\"a} alueita, joihin proteiinit puolestaan tarttuisivat. Hydrofobisina materiaaleina testattiin kaupallista Teflon AF:ia sek{\"a} kaupallisia fluorattuja akrylaatteja. Teflon AF:ia onnistuttiin kuvioimaan litografisia menetelmi{\"a} apuna k{\"a}ytt{\"a}en. Fluorattuja akrylaatteja yritettiin kuvioida fotolitografian avulla siin{\"a} kuitenkaan onnistumatta. Lis{\"a}ksi yritettiin syntetisoida haarautuneen fluoratun sivuketjun sis{\"a}lt{\"a}v{\"a}{\"a} siloksaani-materiaalia julkaistua synteesireitti{\"a} noudattaen, mutta kyseist{\"a} siloksaania onnistuttiin valmistamaan vain todella v{\"a}h{\"a}isi{\"a} m{\"a}{\"a}ri{\"a}. Proteiineja puoleensa vet{\"a}vi{\"a}, stabiileja pintoja onnistuttiin valmistamaan kahdella eri tekniikalla. Toisessa menetelm{\"a}ss{\"a} spinnattiin er{\"a}{\"a}n siloksaanin ja fluoresoivan v{\"a}riaineen seosta substraatille, ja toisessa menetelm{\"a}ss{\"a} fluoresoiva v{\"a}riaine sidottiin kovalenttisesti silyloidun substraatin pinnalle. Fluoresoivan v{\"a}riaineen avulla voitiin tutkia proteiinien tarttumista v{\"a}riainetta sis{\"a}lt{\"a}v{\"a}lle pinnalle k{\"a}ytt{\"a}en hyv{\"a}ksi pinnassa olevan v{\"a}riaineen ja pinnalle kiinnittyneen leimatun proteiinin leimav{\"a}riaineen v{\"a}lill{\"a} tapahtuvaa energiansiirtoa (FRET = Fluoresenssi resonanssi energiansiirto). Mittauksilla saatiin osoitettua, ett{\"a} energiansiirtoa tapahtui kiinte{\"a}n pinnan v{\"a}riaineen ja liuoksessa olevan leimatun proteiinin leimav{\"a}riaineen v{\"a}lill{\"a}. T{\"a}m{\"a} tulos puolestaan osoittaa sen, ett{\"a} proteiinit todellakin tarttuivat valmistettuihin v{\"a}riaine-pintoihin. Valmistettuja hydrofobisia ja proteiineja puoleensa vet{\"a}vi{\"a}, v{\"a}riaineen sis{\"a}lt{\"a}vi{\"a} pintoja tullaan k{\"a}ytt{\"a}m{\"a}{\"a}n hyv{\"a}ksi kehitett{\"a}ess{\"a} edelleen tavoitteena ollutta kuvioitua substraattia.",
author = "Riikka Aho",
note = "CA: ELE pro gradu University of Oulu ; Department of Chemistry 87 + liitt.",
year = "2005",
language = "English",
publisher = "University of Oulu",
address = "Finland",
school = "University of Oulu",

}

Aho, R 2005, 'Hydrophobic and hydrophilic thin films for bioscreening purposes: Master's thesis', Master Degree, University of Oulu, Oulu.

Hydrophobic and hydrophilic thin films for bioscreening purposes : Master's thesis. / Aho, Riikka.

Oulu : University of Oulu, 2005. 87 p.

Research output: ThesisMaster's thesisTheses

TY - THES

T1 - Hydrophobic and hydrophilic thin films for bioscreening purposes

T2 - Master's thesis

AU - Aho, Riikka

N1 - CA: ELE pro gradu University of Oulu ; Department of Chemistry 87 + liitt.

PY - 2005

Y1 - 2005

N2 - Työn tavoitteena oli valmistaa erittäin ohuita hydrofobisia pintoja ja biomolekyylejä puoleensa vetäviä pintoja. Näiden pintojen olisi tulevaisuudessa tarkoitus toimia apuna biomolekyylien seulonnassa. Tavoitteena oli valmistaa substraatti, jossa olisi hydrofobisia alueita, jotka hylkisivät biomolekyylejä (proteiineja) sekä alueita, joihin proteiinit puolestaan tarttuisivat. Hydrofobisina materiaaleina testattiin kaupallista Teflon AF:ia sekä kaupallisia fluorattuja akrylaatteja. Teflon AF:ia onnistuttiin kuvioimaan litografisia menetelmiä apuna käyttäen. Fluorattuja akrylaatteja yritettiin kuvioida fotolitografian avulla siinä kuitenkaan onnistumatta. Lisäksi yritettiin syntetisoida haarautuneen fluoratun sivuketjun sisältävää siloksaani-materiaalia julkaistua synteesireittiä noudattaen, mutta kyseistä siloksaania onnistuttiin valmistamaan vain todella vähäisiä määriä. Proteiineja puoleensa vetäviä, stabiileja pintoja onnistuttiin valmistamaan kahdella eri tekniikalla. Toisessa menetelmässä spinnattiin erään siloksaanin ja fluoresoivan väriaineen seosta substraatille, ja toisessa menetelmässä fluoresoiva väriaine sidottiin kovalenttisesti silyloidun substraatin pinnalle. Fluoresoivan väriaineen avulla voitiin tutkia proteiinien tarttumista väriainetta sisältävälle pinnalle käyttäen hyväksi pinnassa olevan väriaineen ja pinnalle kiinnittyneen leimatun proteiinin leimaväriaineen välillä tapahtuvaa energiansiirtoa (FRET = Fluoresenssi resonanssi energiansiirto). Mittauksilla saatiin osoitettua, että energiansiirtoa tapahtui kiinteän pinnan väriaineen ja liuoksessa olevan leimatun proteiinin leimaväriaineen välillä. Tämä tulos puolestaan osoittaa sen, että proteiinit todellakin tarttuivat valmistettuihin väriaine-pintoihin. Valmistettuja hydrofobisia ja proteiineja puoleensa vetäviä, väriaineen sisältäviä pintoja tullaan käyttämään hyväksi kehitettäessä edelleen tavoitteena ollutta kuvioitua substraattia.

AB - Työn tavoitteena oli valmistaa erittäin ohuita hydrofobisia pintoja ja biomolekyylejä puoleensa vetäviä pintoja. Näiden pintojen olisi tulevaisuudessa tarkoitus toimia apuna biomolekyylien seulonnassa. Tavoitteena oli valmistaa substraatti, jossa olisi hydrofobisia alueita, jotka hylkisivät biomolekyylejä (proteiineja) sekä alueita, joihin proteiinit puolestaan tarttuisivat. Hydrofobisina materiaaleina testattiin kaupallista Teflon AF:ia sekä kaupallisia fluorattuja akrylaatteja. Teflon AF:ia onnistuttiin kuvioimaan litografisia menetelmiä apuna käyttäen. Fluorattuja akrylaatteja yritettiin kuvioida fotolitografian avulla siinä kuitenkaan onnistumatta. Lisäksi yritettiin syntetisoida haarautuneen fluoratun sivuketjun sisältävää siloksaani-materiaalia julkaistua synteesireittiä noudattaen, mutta kyseistä siloksaania onnistuttiin valmistamaan vain todella vähäisiä määriä. Proteiineja puoleensa vetäviä, stabiileja pintoja onnistuttiin valmistamaan kahdella eri tekniikalla. Toisessa menetelmässä spinnattiin erään siloksaanin ja fluoresoivan väriaineen seosta substraatille, ja toisessa menetelmässä fluoresoiva väriaine sidottiin kovalenttisesti silyloidun substraatin pinnalle. Fluoresoivan väriaineen avulla voitiin tutkia proteiinien tarttumista väriainetta sisältävälle pinnalle käyttäen hyväksi pinnassa olevan väriaineen ja pinnalle kiinnittyneen leimatun proteiinin leimaväriaineen välillä tapahtuvaa energiansiirtoa (FRET = Fluoresenssi resonanssi energiansiirto). Mittauksilla saatiin osoitettua, että energiansiirtoa tapahtui kiinteän pinnan väriaineen ja liuoksessa olevan leimatun proteiinin leimaväriaineen välillä. Tämä tulos puolestaan osoittaa sen, että proteiinit todellakin tarttuivat valmistettuihin väriaine-pintoihin. Valmistettuja hydrofobisia ja proteiineja puoleensa vetäviä, väriaineen sisältäviä pintoja tullaan käyttämään hyväksi kehitettäessä edelleen tavoitteena ollutta kuvioitua substraattia.

M3 - Master's thesis

PB - University of Oulu

CY - Oulu

ER -